经过晋元人多年的艰苦努力，学校在教育和教学各方面硕果累累：2011年上海市教委教研室首次公布的学校教学质量评估中，晋元跻身 “A类”学校(全市仅28家)。学校先后六次被评为上海市文明单位、荣获全国三八红旗集体、中国移动中小学校长影子培训校长培训实践基地、联合国科教文组织中国可持续发展教育项目实验学校、全国美育实验学校、中国创造学会创造教育专业委员会首批先进实验基地、全国中小学图书馆先进集体、上海市行为规范示范校、上海市科技教育特色学校、上海市绿色学校、上海市艺术教育特色学校、上海市知识产权示范校、头脑奥林匹克活动特色学校等100多项荣誉称号。
几年来，学校共撰写了60多本近500万字实践“选择教育”理念的书籍;学生综合素质有了很大的提高，一大批学生在国际、国内、市级以上竞赛中获奖。近五年来，晋元每年直升及考入北大、清华全国一流名校的学生占全区的2/3;每年均有多名学生考取全额奖学金赴欧美名校深造;96%的高三学生考入本科院校，其中绝大多数考入全国重点院校，升学率基本达到100%。
